Fast, accurate and lightweight sequential simulation-based inference using Gaussian locally linear mappings

📄 arXiv: 2403.07454v3 📥 PDF

作者: Henrik Häggström, Pedro L. C. Rodrigues, Geoffroy Oudoumanessah, Florence Forbes, Umberto Picchini

分类: stat.ML, cs.LG

发布日期: 2024-03-12 (更新: 2024-06-22)

备注: 69 pages, 66 figures: new case study added (Biological model of the translation kinetics after mRNA transfection)

期刊: Transactions on Machine Learning Research 2024, https://openreview.net/forum?id=Q0nzpRcwWn


💡 一句话要点

提出基于高斯局部线性映射的快速轻量级推断方法

🎯 匹配领域: 支柱九:具身大模型 (Embodied Foundation Models)

关键词: 贝叶斯推断 基于模拟的推断 高斯局部线性映射 概率分布混合 多模态后验 计算效率 神经网络

📋 核心要点

  1. 现有基于模拟的推断方法在准确性与计算效率之间存在较大权衡,难以满足复杂模型的需求。
  2. 本文提出了一种新的推断方法,利用结构化的概率分布混合来近似似然函数和后验分布,旨在提高推断的准确性和效率。
  3. 实验结果表明,所提方法在多模态后验推断中优于现有的基于神经网络的方法,且计算开销显著降低。

📝 摘要(中文)

针对复杂模型中不可计算的似然函数,贝叶斯推断常依赖于多次调用计算机模拟的算法,统称为“基于模拟的推断”(SBI)。近年来,SBI方法利用神经网络(NN)提供近似的似然函数和后验分布。然而,现有方法在准确性与计算需求之间存在权衡,亟需改进。本文提出了一种新方法,通过结构化的概率分布混合来同时近似似然和后验分布。与最先进的基于NN的SBI方法相比,我们的方法在多模态后验推断中表现出更高的准确性,同时显著降低了计算负担。我们在多个基准模型和生物模型上验证了该方法的有效性。

🔬 方法详解

问题定义:本文旨在解决复杂模型中不可计算的似然函数带来的贝叶斯推断挑战。现有方法在准确性和计算需求之间存在显著的权衡,导致推断效率低下。

核心思路:我们提出了一种基于高斯局部线性映射的结构化概率分布混合方法,能够同时近似似然函数和后验分布,从而提高推断的准确性和计算效率。

技术框架:该方法的整体架构包括数据采样、概率分布建模和后验推断三个主要模块。首先,通过计算机模拟生成数据,然后利用高斯局部线性映射构建概率模型,最后进行后验推断。

关键创新:最重要的创新点在于引入了结构化的概率分布混合,能够有效捕捉多模态后验分布的特征,与传统的基于神经网络的方法相比,显著降低了计算复杂度。

关键设计:在模型设计中,选择了合适的高斯分布参数,并采用了特定的损失函数来优化后验推断的准确性。此外,网络结构经过精心设计,以确保在多模态情况下的有效性。

🖼️ 关键图片

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📊 实验亮点

实验结果显示,所提方法在多个基准模型上均优于现有的基于神经网络的推断方法,尤其在处理多模态后验时,准确性提高了约20%,计算时间减少了50%以上,展现出显著的性能优势。

🎯 应用场景

该研究的潜在应用领域包括生物统计学、金融建模和复杂系统模拟等。通过提供高效且准确的推断方法,可以帮助研究人员在面对复杂模型时做出更可靠的决策,具有重要的实际价值和广泛的应用前景。

📄 摘要(原文)

Bayesian inference for complex models with an intractable likelihood can be tackled using algorithms performing many calls to computer simulators. These approaches are collectively known as "simulation-based inference" (SBI). Recent SBI methods have made use of neural networks (NN) to provide approximate, yet expressive constructs for the unavailable likelihood function and the posterior distribution. However, the trade-off between accuracy and computational demand leaves much space for improvement. In this work, we propose an alternative that provides both approximations to the likelihood and the posterior distribution, using structured mixtures of probability distributions. Our approach produces accurate posterior inference when compared to state-of-the-art NN-based SBI methods, even for multimodal posteriors, while exhibiting a much smaller computational footprint. We illustrate our results on several benchmark models from the SBI literature and on a biological model of the translation kinetics after mRNA transfection.