Agentic generation of verifiable rules for deterministic, self-expanding reaction classification

📄 arXiv: 2607.01061v1 📥 PDF

作者: Daniel Armstrong, Maarten Dobbelaere, Valentas Olikauskas, Helena Avila, Octavian Susanu, Jérôme Waser, Philippe Schwaller

分类: cs.AI, cs.CL

发布日期: 2026-07-01


💡 一句话要点

提出全自动化多代理框架以解决化学反应分类问题

🎯 匹配领域: 支柱九:具身大模型 (Embodied Foundation Models)

关键词: 化学反应分类 大型语言模型 自动化系统 动态数据库 反应规则生成 多代理框架 机器学习 符号系统

📋 核心要点

  1. 现有的化学反应分类方法依赖于固定的规则集,无法适应新化学,且手动编码工作量巨大。
  2. 本文提出的全自动化多代理框架利用大型语言模型,能够自动分类反应并生成规则,显著提高了分类的灵活性和准确性。
  3. 实验结果显示,该方法对未见反应的分类准确率达到97.7%,并将反应分类从68类扩展至14,073类,表现出优越的性能。

📝 摘要(中文)

计算机辅助合成规划通过将目标分子分解为可获取的前体,利用大量反应规则库为每个转化分配确定性且可解释的标签。然而,化学领域的长尾特性使得手动编码变得不可行,现有工具依赖于固定的规则集,无法适应新化学。本文提出了一种全自动化的管道,利用大型语言模型的多代理框架对665,901个美国专利反应进行分类并自动生成规则,且在验证循环中测试每条规则。该方法将标准分类法从68类扩展至14,073类,无需人工整理。通过轻量级指纹分类器,该方法对未见反应的分类准确率达到97.7%,与领先的专有分类器相匹配,同时更细致地解析化学,并能够根据需求扩展至训练分布之外的化学。最终形成了一个动态的反应性数据库,为将生成模型转变为可靠的自扩展符号系统提供了一般性路径。

🔬 方法详解

问题定义:本文旨在解决现有化学反应分类方法的局限性,尤其是固定规则集无法适应新化学的挑战,以及手动编码的不可行性。

核心思路:通过构建一个全自动化的多代理框架,利用大型语言模型(LLMs)对化学反应进行分类并自动生成反应规则,形成一个动态的反应性数据库。

技术框架:该方法包括多个模块:首先,使用LLMs对反应进行分类;其次,在验证循环中测试生成的规则;最后,利用轻量级指纹分类器进行反应的最终分类。

关键创新:最重要的创新在于实现了反应规则的自动生成和分类,且在没有人工干预的情况下,将反应分类从68类扩展至14,073类,显著提高了分类的灵活性和准确性。

关键设计:在设计中,采用了轻量级指纹分类器以提高分类效率,并在验证过程中引入了循环测试机制,以确保生成规则的有效性和准确性。

🖼️ 关键图片

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📊 实验亮点

实验结果表明,该方法对未见反应的分类准确率达到97.7%,与领先的专有分类器相匹配。同时,反应分类的扩展从68类增加到14,073类,显示出显著的性能提升,能够更细致地解析化学反应。

🎯 应用场景

该研究的潜在应用领域包括药物发现、材料科学和化学合成等。通过提供一个动态更新的反应性数据库,研究人员可以更高效地探索新化学反应,推动新材料和药物的开发。未来,该方法有望在化学领域广泛应用,提升反应分类的自动化水平。

📄 摘要(原文)

Computer-assisted synthesis planning breaks target molecules into accessible precursors using large libraries of reaction rules that assign each transformation a deterministic, interpretable label. But chemistry is long-tailed, making manual encoding intractable, and existing tools rely on fixed rulesets that cannot adapt to new chemistries. Here we present a fully automated pipeline in which a multi-agent framework of large language models (LLMs) classifies reactions and writes the rules themselves across 665,901 US patent reactions, generating each rule under a verification loop that tests it against the corpus. It expands a standard taxonomy from 68 to 14,073 classes without human curation. With a lightweight fingerprint classifier, it classifies 97.7\% of unseen reactions, matching a leading proprietary classifier while resolving chemistry more finely and extending on demand to chemistry outside its training distribution. The result is a living reactivity database and a general route to turning generative models into reliable, self-expanding symbolic systems.