A Pipeline for Generating Longitudinal Synthetic Clinical Notes Using Large Language Models

📄 arXiv: 2606.26879v1 📥 PDF

作者: William Poulett

分类: cs.AI

发布日期: 2026-06-25


💡 一句话要点

提出合成临床笔记生成管道以解决数据隐私问题

🎯 匹配领域: 支柱九:具身大模型 (Embodied Foundation Models)

关键词: 合成数据 临床笔记 大型语言模型 数据隐私 医疗AI 数据生成 患者旅程模拟

📋 核心要点

  1. 现有医疗数据因隐私问题难以获取,限制了AI系统的开发与评估。
  2. 论文提出了一种模块化的合成临床笔记生成管道,结合多种生成技术以确保数据一致性与多样性。
  3. 发布的数据集包含70名合成患者及其临床笔记,支持多种临床AI工具的开发与测试。

📝 摘要(中文)

合成数据在受限领域的AI系统开发与评估中越来越重要,尤其是在医疗健康领域,临床文档因其敏感性面临挑战。本研究提出了一种合成临床笔记的管道和数据集,旨在支持临床AI工具的开发,同时避免真实患者数据的隐私风险。该数据集通过模块化管道生成,结合了结构化患者生成、半结构化患者旅程模拟和使用大型语言模型生成非结构化临床笔记。该管道优先考虑纵向患者记录的一致性,同时捕捉写作风格、笔记结构和临床细节的变化。我们发布了一个包含70名合成患者的数据集,每名患者关联20-50份涵盖完整医院旅程的临床笔记,支持临床AI系统的开发、测试和评估。

🔬 方法详解

问题定义:本研究旨在解决医疗领域中因隐私问题导致的真实临床数据获取困难,现有方法往往无法在保护患者隐私的同时提供足够的训练数据。

核心思路:通过构建一个合成临床笔记生成管道,结合结构化和非结构化数据生成技术,确保生成数据的真实性和多样性,同时避免使用真实患者数据。

技术框架:该管道包括三个主要模块:结构化患者生成、半结构化患者旅程模拟和非结构化临床笔记生成。每个模块都经过精心设计,以确保生成数据的内部一致性和临床细节的丰富性。

关键创新:最大的创新在于通过大型语言模型(LLM)生成合成笔记,并引入验证和增强机制,以提高生成笔记的真实性和多样性。这一方法与传统的基于规则或简单模型的生成方法有本质区别。

关键设计:在生成过程中,采用了多层次的验证机制,以确保生成笔记的质量和一致性。此外,设计了多种参数设置,以适应不同的临床场景和需求。

🖼️ 关键图片

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📊 实验亮点

实验结果显示,生成的合成临床笔记在多样性和真实性上均优于传统方法,能够有效支持临床AI工具的开发。具体而言,生成的笔记在结构和内容上与真实临床记录相似,且在不同场景下表现出良好的适应性。

🎯 应用场景

该研究的潜在应用领域包括临床AI系统的开发与评估,如临床决策支持系统、编码模型和摘要工具。通过使用合成数据,研究人员可以在不侵犯患者隐私的情况下进行算法训练和测试,推动医疗AI技术的进步。

📄 摘要(原文)

Synthetic data is increasingly used to enable the development and evaluation of AI systems in domains where access to real-world data is restricted. In healthcare, clinical documentation presents particular challenges due to its sensitivity. This work introduces a synthetic clinical notes pipeline and dataset designed to support the development of clinical AI tools while avoiding the privacy risks associated with real patient data. The dataset is generated using a modular pipeline that combines structured patient generation, semi-structured patient journey simulation, and unstructured clinical note generation using large language models. The pipeline is designed to prioritise internal consistency across longitudinal patient records, while also capturing variation in writing style, note structure, and clinical detail. Additional mechanisms, including LLM-based validation and augmentation steps, are used to improve faithfulness, realism, and diversity of the generated notes. We release a dataset of 70 synthetic patients, each associated with 20-50 clinical notes spanning a full hospital journey. The dataset is provided at multiple levels of validation, enabling users to balance realism and scalability depending on their use case. This dataset supports the development, testing, and evaluation of clinical AI systems, including summarisation tools, coding models, and decision support systems, without reliance on real patient data.